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少数鸟类在部分地区和时间内，有时能对人类经济活动造成损失，其中最主要的是食谷鸟类对农作物的危害，以至国际生物学规划组织（ＩＢＰ）专门成立了“食谷鸟类工作组”，有计划地研究有关食谷鸟类的生活习惯和控制危害的措施。主要毁坏作物的鸟类是鹦鹉、鸦类、椋鸟、拟椋鸟、文鸟和雀科听少数种类，在世界范围造成危害的麻雀就属于文鸟科中的一种。美国１９７０年因鸟害造成的农业损失有六百万蒲氏耳玉米，相当总产量的０.２％。不过对谷物威胁最严重的地区是热带，例如非洲生活的一种文鸟，集成数以千计的大群，一棵大树上能有４００个鸟巢，据估计一百万只鸟每天能毁坏６０吨谷物。对于这些害鸟，进行适当的猎捕和控制，可以化害为益，为人们提供相当的肉类的。
还有极少数鸟类，例如鹦鹉、家鸽、环颈雉、家鸡和麻雀等的体内，曾分离出能在人、禽、畜间传染流行病（例如鹦鹉热、脑炎、马睡眠病等）的病毒。虽然这在我国的发病率尚极低，但应引起特别是养禽人员的重视，例如北京地区已发现少数由家鸽传播的脑炎病例。
此外，鸟类粪便对城市建筑物的污染，在一些城市公园、名胜古迹和国防设施等地能造成损失；少数鸣声刺耳的群居性鸟类（例如乌鸦与麻雀）还产生噪音。一些海鸟以及迁徙鸟类在偶然条件下（例如大
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