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黑长臂猿海南亚种俗称为海南长臂猿，是我国海南岛的特产。迄今为止已经进行的研究结果表明，海南长臂猿在形态、生态习性、行为等诸多方面与其他地区所产的包括黑长臂猿云南亚种在内的各种长臂猿均有所不同，特别是成体毛色的性二型，即雄兽和雌兽体色和形态之间的差异最为典型，其生物学意义还有待进一步探索。海南长臂猿的毛色在一生中有所变化，幼仔不论雄性还是雌性，出生的时候体色都是金*的，长到6个月左右毛色开始变成黑色，首先是肩部、背部和手臂、臀部，然后再扩大到身体的其他部位，最后是腹部。雄兽的体毛完全变为黑色后就不再变化，但雌兽在达到性成熟的年龄时，毛色却又从黑色逐步变成淡*。
此外，海南长臂猿的群体结构有一雄多雌的现象，而其他各种长臂猿都是一雄一雌结构，专家认为，这种独特的群体结构是海南长臂猿对栖息地受到破坏的一种新的适应现象；海南长臂猿群体领域的面积明显较大，这可能是它的分布区处于亚热带雨林的北缘，食物条件不如东南亚典型的热带雨林的缘故；海南长臂猿鸣声的声学结构，也与其他几种长臂猿不尽
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