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布分在复杂洞穴之间。第三类是临时洞穴，极简单，一般只有一个出口，一个盲端。洞道长度约70—100厘米，直径不规则，为临时避敌之用。这类洞穴数量极少。
由于在高山永冻层不到1米的地带，藏鼠兔不可能把洞穴挖得很深，所以分散的洞穴系统使它们可以拥有广阔的觅食范围，而且在危险的时候能及时躲入最近的洞穴里。
藏鼠兔很容易受到几种捕食动物的捕食，它们不会离开自己安全的洞穴太远。藏鼠兔的觅食行为受天敌的很大影响。首先，它宁可在洞穴附近过牧的草场觅食，也不远离洞穴到比较丰美的草场觅食。其次，最容易遭到攻击的年幼个体比成年个体的活动范围更加靠近自己的洞穴。怀孕的雌兽因需要更多的食物，才不得不扩大觅食范围，但离洞穴越远，遭到捕食的风险也越大。有趣的是，当科学家在藏鼠兔的栖息地摆上一排狭长的石块作为它们应对捕食的避难所时，它们就敢于到离洞穴更远的地方去觅食了。
显然，藏鼠兔在觅食时必须防范被其他动物吃掉，有时为了安全就不得不牺牲一些能量收益。这种权衡可以借助多种方式实现。一种方式是尽可能减少觅食时间，由于觅食时很难同时监视捕食者，因此被捕食的风险将随着觅食时间的增加而增加。另一种方式是选择到安全的地点觅食，哪怕那里的食物并不太丰富。
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