科学家从形态学上观察,认为鸭嘴兽应归属于鸟类,其理由是:它那扁平的鸭嘴形嘴巴是角质的,没有哺乳动物特有的肉质的口唇;成年动物与鸟类一样,没有牙齿;尾巴扁平而宽阔;脚上长蹼,善于游泳;以下蛋来繁殖后代,胚胎靠卵黄的营养发育;雌体只有一侧生殖器官发生作用。这一系列特征都和鸟类相似。另一些科学家却认为,鸭嘴兽靠乳汁来哺育幼仔,浑身密布着浓褐色的短兽毛,应该归于哺乳动物。
经过多年的争论,最后,动物学家以兽毛和哺乳作为分类的主要依据,将鸭嘴兽列入哺乳动物,称它为卵生的哺乳动物。因为在动物世界里,只有哺乳动物才有圆形的毛(鸟类的羽毛是扁的),才分泌真正的乳汁,而这两点鸭嘴兽都具备了。此外,鸭嘴兽还有肌肉质横膈膜、左体动脉弧(鸟类只有右体动脉弧),这些也是哺乳动物的特征。至于“鸭嘴兽”一名,是在这种动物被确认为兽类以后,根据它的嘴和鸭嘴相似才取名的。
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