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所谓食物链，是指生物之间的弱肉强食、互相依存的食物关系，俗话说“大鱼吃小鱼，小鱼吃虾米，虾米啃泥底”，就生动而形象地比喻了这种相依为命的食物链关系。 南大洋食物链的最初一环是浮游植物，主要是硅藻，这和世界其他海洋的情形一样。浮游植物能进行光合作用，在阳光下把二氧化碳和水变成有机物，即把太阳能转变成化学能贮存起来。浮游植物是初级生产者，以此供养其他消费者。 食物链的另一个环节是浮游动物，在南大洋中主要是磷虾，它们以浮游植物为饵料。反过来，浮游动物又是其他更高一级营养级的生物，如海豹、企鹅和鲸的食物。 食物链中的最后一环是人类对海洋生物资源的开发和利用，多年来，人们已对南大洋的磷虾、鱼类、海豹和鲸等进行过不同程度的开发。 南大洋的食物链是相当脆弱的，这是因为南极大磷虾在食物链中是关键的一环。在南大洋这个海洋牧场上，有繁茂的浮游植物，90％以上为硅藻，它们是数量惊人的南极大磷虾的饵料，反过来，磷虾又维持着种类不多，但数量惊人的高等动物的生命，如海豹、企鹅和鲸等。一旦磷虾这一环节被打断，南大洋的整个食物链就破坏了。 南大洋生物稠密而丰富的原因，主要是由于来自北部温暖洋流的水体含有丰富的氮、磷等营养盐，形成上升流涌到表层，促进了浮游植物的生长。在上升流区和南极大陆近岸水中，浮游植物异常丰富，人们可以看到它们把海水或浮冰“染”成深绿或棕色。丰富的浮游植物为浮游动物提供了充沛的饵料，浮游动物又供养了其他高等动物。
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