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1977年，伍斯提出生命体系应划分为三界。第一界是真核生物，第二界是原核生物，第三界是古核生物。1996年，产甲烷球菌的全基因组序列测定，为三界学说提供了可信证据。长期以来，两界学说统治着生物界，认为生物划分为原核、真核两大界，真核生物由原始的原核生物进化而来。随着对原核生物各类群的深入研究，发现许多生活在极端环境如高盐、高温、高压、极端的pH值的古细菌，在生理化方面与真细菌存在巨大差异，分子机制亦很独特，许多学者对两界学说提出怀疑。20世纪70年代中期，伍期研究ssrRNA(原核16S，真核18S)发现这类微生物应当从原核生物中独立出来，成为真核、原核两大界之外的第三界。三界生物都来自祖细胞。
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