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也执行着其他蛋白质现在完成的功能。RNA生物在获得了合成多肽的能力后，RNA聚合酶的功能就逐渐从RNA转向蛋白质，其中的一种蛋白质就是RNA依赖RNA聚合酶，它保证了这些生物有效繁殖。
研究人员认为，最早的RNA依赖RNA聚合酶应该是他们研究的蛋白质最简单的一种结构。这个最古老的酶包含一个DPBB结构域。后来，由于复制转变了两个DPBB结构。刚开始它们是一样，以后出现了一些差别，其功能也随即不同。这意味着在这个阶段进化方向发生了分离：有些RNA聚合酶变成了RNA依赖，而其他的则变成了DNA依赖，也就是拥有了在DNA基础上合成RNA的能力。
研究人员认为，他们的发现对生命起源学说提供了一个新证据：最古老的非病毒RNA依赖RNA聚合酶不是在最原始的生命中保留了下来，而是在比较高级的真核细胞生物中保留下来，并在这一过程中改变了其功能———在RNA世界它负责复制遗传信息，而在真核细胞中则作为RNA干扰系统的一部分保留了下来。
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