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通过使用MSDK研究乳腺癌组织，研究人员检测了乳腺管中的上皮细胞和肌上皮细胞以及环境细胞——基质细胞（stoma）。 他们在这些细胞类型中发现了在正常乳腺组织细胞中不存在的由表观遗传甲基化修饰导致的基因表达的变化。大多数乳腺癌发生在乳管的内层。一些癌变损伤在若干年内被限制在乳管中即原位管癌（DCIS，ductal carcinoma in situ）。Dana-Fafrver的研究人员之前发现微环境的基质细胞（不是恶性细胞本身）能够刺激乳管中的癌细胞进行更具侵略性的活动。这些发现为靶向基质细胞以及肿瘤细胞的化疗治疗提供了一个理论根据。这种新方法和新发现还有助于生物标记的发现，并因此帮助提高乳腺癌早期诊断能力 。
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