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技术所得到的基因表达图谱确实和同步定量PCR 技术所得到的资料相符合，而且特别是对于那些具有高度表达水平的基因有相当稳定的一致性结果。不过，对于具有较低表达量的基因标的而言，各系统间就存在着差异。研究人员因此认为，不同技术与不同平台之间的分析结果对于一些具有正常活动表达量的基因而言，还不至于有很大的差异；但是低表达量的基因活动确实有技术上的困难，有待科学家进一步发展更灵敏的分析技术来克服。
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