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    新技术:测序如何加快100倍的

    生物通报道:蚂蚁虽小,可是它们团结起来可以消灭大象。细菌更小,但是它也可以将相对庞大的人体逐步腐蚀掉。其中的秘诀就在于它们庞大的数量。最近Nature的网络版刊登了一篇利用皮升(picolitre)级反应器进行测序方法的文章,它将测序的速度又往前推进了100倍。这无疑是分子生物学上的又一次飞跃,这意味着大概只需100天我们就可以测出人类基因组了。之前生物通已经对此事件做了新闻报道,快速基因组测序时代到来。现在让我们来对这种方法进行进一步的了解。最新发明的方法是一种结合了一种乳胶材料和皮升级反应孔的焦磷酸盐测序法。它一个典型的反应可以在4小时内测出2千5百万个碱基,其准确率可达到99%。利用Sanger毛细管电泳法测序平均每个小时可读6万7千个碱基,平均准确率为99.4%。事实上,这种新的测序方法单个反应的读取碱基数和准确率都不及毛细管电泳法,它之所以能最后平均起来比经典方法强在于普通测序一次只能利用96孔板进行反应,而这种新型测序所采用的介质玻片上面有一百六十万个孔,平均下来自然比传统方法强。这种新型的测序方法的第一步就是将基因组DNA进行随机切割,而不需要在细菌进行亚克隆或者处理单个克隆,整个测序反应都是批量进行的。切割后的DNA会加上特定的共同接头(adapter),然后DNA吸附到各自的珠子上,倒入乳胶状物质,之后每滴乳胶颗粒上发生测序的PCR反应(如下图所示)。图片来源:N
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