Affymetrix首次公布大量SNP数据

[生物通讯]生物芯片业的领头羊Affymetrix公司日前公开了120,000个单核苷酸多态性也就是SNP的数据，－－这些SNP都在几十名志愿者中进行了检验。一次性公布如此之多已被明确识别出来的SNP对于私营公司而言还是第一次，研究人员希望这些数据有助于深入探索特定疾病与遗传变异之间的联系。SNP指的是DNA上某一核苷酸被另一核苷酸替换，许多遗传学家认为个体的SNP也就是更广泛的SNP模式有助于解释不同个体对从癌症到糖尿病等多种疾病的易感程度不同。但目前公共数据库中的近6百万个SNP中的大多数都尚未在多人中进行检验。这意味着这些SNP可能是罕见的，因此对于常见疾病的研究不适用。还有一些SNP可能是技术上的错误，人类单倍型图谱计划(HapMap)的科学主任、麻省理工学院Whitehead研究所的Stacey Gabriel表示。获得准确的SNP对于致力于该图谱计划的研究人员尤其重要，因为该图谱就是基于大片段DNA是成片继承的，每个都可定义为一组SNP这一理论。为确定某个SNP在人群中出现的频率，Affymetrix公司首先检查了其中的500,000个SNP。约有一半来自公共数据库，另外一半来自Affymetrix的一个子公司－－加州Mountain View的Perlegen科学公司。Perlegen去年绘制了自己的单倍型图谱。以前该公司几乎没有公布过任何有关该图谱的数据。这些新SN
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