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    识别基因功能的新方法

    [AD340X300][生物通讯]几乎每周都有一个新基因组被测序完毕,但将序列信息转化为对个体基因的了解还是一个艰巨的任务。发表在上周《生物学杂志》(Journal of Biology)的一篇新研究提出了简化这个任务的方法,文章描述了一个可以大大提高个体基因如何调控的预测准确率的新网络工具。Wyeth Wasserman博士和他的研究小组发明了一个功能强大的识别哪些转录因子调控哪些个体基因的两步方法。这个新方法比原来的此类方法选择精度大得多,使一次搜索中找到的无关转录因子数目减少了85%。现在,研究人员已通过网络将该工具向所有研究人员公布。这个基于网络的技术对于分析编码序列未给其功能提供任何线索的基因尤其有用。预测的人类基因中大约有30%不含可识别的域。通过了解哪些转录因子控制一个特殊基因的表达,科学家能够获知这个基因与什么过程有关。这是因为转录因子本身就被严格调控以确保基因只在特定的部位和时间表达,而关于哪些事件可以激活哪些转录因子已有很多了解。文章作者说:“对一个起调节作用的转录因子身份的了解可以为研究一个基因的功能提供重要线索。”转录因子是通过结合到编码区上游调控区域的特殊序列起作用的。但它们可以耐受这些序列中存在大量变异。这意味着寻找转录因子结合的上游调控序列也
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