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[生物通讯]一个以对植物产生危害的重要微生物为测序目标的新基因组计划将有助于抵御无数农业病虫害,以及对加州的橡树产生巨大破坏作用的橡树骤死综合征。 60种原生生物种水霉Phytophthora中的每一种都对植物产生危害。其中最著名的当属引起20世纪马铃薯作物种植失败从而促使爱尔兰居民向北美迁移的一种水霉,但还有另外两种水霉至今仍然对农业有着重要影响。大豆疫霉菌(Phytophthora sojae)导致大豆根部腐烂,这种病害导致全世界每年损失10多亿美元。而另一种引起橡树骤死综合征的P. ramorum,使加州和俄勒冈美丽的橡树林逐渐枯竭,对其它林带也造成威胁(ScienceNOW, 10 January)。 现在,3个联邦政府机构(美国能源部、美国国家科学基金会和美国农业部)联合拨款4百万美元资助对 P. ramorum 和P. sojae的全长基因组进行测序和分析。研究人员在加州Walnut Creek的联合基因组研究院的Jeffrey Boore领导下,将测序和组装这两种原生生物的序列草图,而由弗吉尼亚生物信息学研究院的Brett Tyler领导的研究小组将通过破译这些序列数据识别基因并对基因的功能做出解释,这些基因信息有望在一年内公布。Tyler表示,在一项新的合作 < 1 > < 2 >
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