康柏上市遗传基因序列相似性搜索系统

于精度的提高，搜索序列的长度也增加了，所以搜索起来需要很长的时间。         BioChopper通过将遗传基因序列等数据库进行分割，并分配给构成群集的各计算机节点(服务器)，从而实现并行搜索。在该公司的验证试验中，对具备约190亿个碱基的DNA数据库进行了约1000个碱基的相似性搜索，从结果来看，与利用配备32 CPU的群集进行单一数据库搜索相比，搜索时间缩短到了1/32。         同时，由于BioChopper与其所利用的NCBI BLAST本身没有直接关系，因此即使是在NCBI BLAST进行版本升级以后，也可以立即投入使用。         另外，日本康柏计算机截止目前销售的相关软件产品有：生物学专用全文搜索系统“BioSearcher”、基于Web的可视性相似搜索工具“BioFinder”、以及可通过因特网从已经公开的序列信息数据库中自动进行数据收集和更新的系统“BioCollector”等。         摘自：日经BP社
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