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病毒也隐藏着潜在的问题。Bushman用这些逆转录病毒感染人类细胞，检查它们会着陆于什么部位。去年，Bushman曾报道，这些病毒着陆于基因－－尤其是活化基因－－而不是基因之间的区域的可能性更大。Bushman在会议上说，现在这些病毒好像更喜欢着陆于一旦错误打开或关闭就会诱发癌症的基因内。在共440次基因插入试验中，5％发生在已知的“癌基因”内，－－虽然癌基因只占所有基因的1.6％。“看来我们对插入癌基因的情况存有极大的偏见。”Bushman说。“这可能不是最重要的消息。”但他强调说还没有人知道这些插入是否会打开或关闭癌基因，或是否确实对癌基因有任何影响。尽管发现了这些问题，但大多数基因治疗专家仍保持乐观态度。“我不认为这些问题意味着逆转录病毒基因疗法末日的到来。”纽约Sloan-Kettering 癌症研究中心的Michel Sadelain 表示。”有很多方法可以降低基因治疗可能带来的癌症风险。包括改造病毒使它们将基因只插入到基因组的特定位点，或补充自我破坏机制使医生在细胞出现缺陷时将它们杀死，Sadelain说。会议期间，FDA顾问委员会上周建议27例搁置的基因治疗试验应该继续进行－－如果基因治疗是唯一的选择。同样，伦敦Great Ormond Street 儿童医院也将用基因治疗治疗X-SCID男童，如果死亡是除此之外的唯一选择。但法国试验仍未解禁。
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