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纽约消息:斯坦福大学医学中心的研究者本周二说他们已经建立了含有线虫Caenorhabditis elegans94%基因组的DNA芯片。研究者使用微阵列研究C.elegans发育过程中的基因表达和两种性别的基因表达,并且发现了总共2171个性别调控的基因。据领导这项研究的Stuart Kim说,相对于以前已知的少数目标而言,这是一个明显的增加。被广泛研究的模型生物C.elegans,其全基因组在1998年被测序,是基因组有如此大部分包括在芯片中的第一个生物。斯坦福的微阵列含有C.elegans基因组目前被注释的18967个基因中的17871个基因。该研究的所有细节将发表在1月2日出版的Proceedings of the National Academy of Sciences上。含有全部基因组的如此大规模的DNA微阵列对研究基因表达模式而言将是必须的,而后者是使用基因组测序数据研究基因功能的下一步。Kim说:“基因组之前,你将会考虑那些基因编码的是什么蛋白,然后是如果敲除基因将会发生什么?基因组之后,你将有大量的被调控的基因的表达数据……不管你所研究的是什么基因,都存在一个可以用来说明这些基因如何工作的表达字典。”其它研究C.elegans的实验室将可以获得这种芯片,它们将自己制备RNA,而微阵列实验将在斯坦福完成,而结果将公布在网上的斯坦福线虫芯片数据库(http://www. < 1 > < 2 >
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