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    超级计算机建立SARS病毒酶模型

    重要,并且对战胜新出现的传染疾病也是至关重要的。这项研究还是多个低成本、家用计算机联合用于大规模生物系统模拟的成功例子。自从2003年初SARS爆发,各国研究人员竞相研究这种关键的SARS病毒酶的三维结构,希望促进药物设计的发展。到目前为止,三个独立的X射线结晶学研究组已经破译了它的三维结构(用原子坐标表示)。2003年4月30日,Pang博士将他的由计算机得到的三维瞬时结构图存入蛋白质数据库(Protein Data Bank),并且在2003年7月2日将这些结构公布于世,这个结果比最早的X射线晶体衍射结果公布早了27天。现在Pang博士利用他个性化的计算机对一个他们的小组构建的Mayo内部化合物数据库进行评估。这个数据库包含250万不同的化合物的分子质量、形状和极性特征。他的目的是将它们的特性与计算机发现的关键SARS病毒酶的动力学特性进行匹配,以此找到抗SARS药物。Pang博士和Andrea Dooley在Mayo完成了这项研究并将20个计算机确定的小分子送到了Birmingham, Ala.的南方研究所,用于进一步的抗SARS药物检测。此外Pang博士还在改进这个计算机系统的性能,目标是达到每秒千万亿次( petaflops)浮点运算的级别。(Yang Shujuan)
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