生物信息学领域的首要竞争对手——Linux clusters平台才是。当越来越多的HPC用户转向Linux clusters平台以便以较低费用满足他们处理数据需要时，很多人并没有考虑包括维护费在内的整体费用。 意识到来自Linux的威胁后，SGI 随即开发了一个12-CPU基准的系统来与32-CPU 的Dell PowerEdge 2250 (1 GHz Pentium III)竞争。每一系统每天可进行100,000个BlastX搜索，在超过600,000个序列的数据库中查询1140个EST序列。SGI计算出拥有Origin 300 ，3年的所有花费为140,100美元，而Linux clusters平台则需要$225,600美元。 上周SGI还发布了其TP900存储系统，这是一个入门水平的磁盘组，既可独立运作也可作为Origin 300的扩展模块。 Origin 300的发布正好是在SGI与Incyte 合作在Bristol-Myers Squibb安装基于Linux的生物信息学系统的一年之后。 2000年11月，Bristol-Myers成为Incyte-SGI系统的第一个签约用户，它将Incyte的Linux clusters平台与SGI的Origin 2000服务器连接在一起。这个医药界巨子宣称计划将该系统用于基因和蛋白质序列分析、转录机制以及蛋白质组学。
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