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    重要研究进展:原核生物的RNA沉默系统

    A沉默现象。而来自NIH的研究人员从生物信息学的角度第一次提出,一种在古细菌和细菌里发现的串联重复序列——Clustered Regularly Interspaced Short Palindrome Repeats (CRISPR)也许与其它CRISPR—associated(cas)蛋白相关的基因家族一起担当着对抗噬菌体和质粒RNA的防御作用。而许多Cas蛋白都包含着在真核生物中与RNA干扰有相同功能的蛋白的结构域,因此研究人员这可能是原核生物的RNA沉默系统。这些分析主要来源于对NCBI数据库中古细菌和细菌基因组中CRISPR和cas基因数据的比较,通过比较研究人员发现了许多总是定位于CRISPR簇附近的cas基因,这些基因可能编码一些与RNAi机制相关(比如解旋和切除)的蛋白,包括一个Dicer酶类似物,几个Slicer类似物。但是这些类似物与Dicer,Slicer基因序列并不相似,因此可以说不是同源基因的。同时研究人员还发现CRISPR一部分插入片段(inserts)与病毒和质粒基因组相似,由此研究人员分析推测所有的CRISPR inserts都是来源于病毒或者质粒,但由于大部分还是未知的,因此这种来源性不是那么明显,并且他们还认为这些inserts是通过形成一个双层结构(被Cas蛋白切除后可以降解外来RNA)由沉默的噬菌体或者质粒转录序列得到的。这一发现打破了原有的对RNA沉默的概念,虽然还只是生物信息学方面的证实,但是随着研究的深入,很有可能是扩展现有RNA沉默的定义,为研究RNA沉默提供进化上的,整体性的帮助。
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