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同发育阶段的细胞表观遗传的基本差异。染色质的修饰因子可能在胚胎干细胞中处于相对不活泼的状态，从而产生一种很容易对转录调节因子作出应答的表观基因组学特征，并赋予细胞多种发育选择。 当细胞分化时，抑制性的染色质修饰可能使表观基因组的可塑性降低，从而逐渐抑制了发育的血统选择，增加了程序重调的难度。研究人员还发现神经干细胞与一个Nanog转基因的转染对神经干细胞的显型没有硬性——这意味着Nanog与其他尚未知道的胚胎干细胞因子一起编排这种多功能性。
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