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    代谢整合方法加速蛋白质鉴定过程

    种甲硫氨酸的类似物;如果甲硫氨酸在混合物中被遗漏了,细胞的翻译机制可以将其插入进来替代甲硫氨酸。AHA的侧链包含有一种叠氮化物功能基团,这种基团在自然界中并不存在;但是会自发地和一种炔发生反应以形成一种共价键,这种炔是自然界中并不存在的另一种功能基团。为了从蛋白质组整体库中分离出新合成的由叠氮化物标记的蛋白质,Schuman及其同事开发出了一种以炔为基础的亲合键试剂,它包含有一种旗舰抗体抗原决定基和生物素,这些物质构成了一种和抗生物素蛋白有密切联系的共价组合。这些研究者将他们的标记策略“生物正交非规范性氨基酸标记”简称为BONCAT。    作为这一原则的证据,研究者将人类胚肾细胞293暴露于AHA的环境中两个小时。他们应用免疫印迹技术,来验证AHA是如何被整合入多个蛋白中的。他们使用生物素旗舰炔亲合试剂来孵化细胞溶解产物,还使用抗生物素蛋白树脂来分离新合成的AHA标记蛋白。他们在这一树脂中消化非活动性的蛋白,然后对这些片段进行鸟枪质谱分析和数据搜寻研究。他们成功地鉴定出了1028种必要型缩氨酸,它们构成了195种新合成的不同蛋白,这些蛋白具有功能和生化特征方面的多样性。    Schuman及其同事深信他们的方法提供了一种独特的简单线路,以获得各种哺乳动物细胞蛋白质组的瞬间快照。他们建议,BONCAT在细胞培养的后有丝分裂阶段对于新陈代谢标记可能会非常有用,在这当中,稳定的同位素标记法应用于轻型和重型氨基酸变异物正显得非常有挑战性。    注:夏雨译自2006年8月号的《自然-方法学》,版权为英国NPG出版集团所有。更多信息请访问:http://www.natureasia.com/ch/naturemethods
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