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    生物信息二级数据库构建简介

    生物信息学是一门迅速发展的新兴交叉学科, 它从事对基因组研究相关生物信息的获取、加工、存储、分配、分析和解释. 一是对海量数据的收集、整理与服务, 特别是构建收集有关人类疾病、生长的数据库; 二是从中发现新的规律, 这就需要研究好的算法对这些数据分析,得到其中的关键联系.在生物学领域时刻有大量关于基因、蛋白质等的数据生成,必须借助计算机来交换和处理分散且海量的数据, 从而发现隐含在数据中的信息.现在,国际三大核酸数据库Genbank, 欧洲分子生物学实验室(EMBL)的数据库和日本的DNA数据库(DDBJ)是被广泛使用的一级数据库, 他们将来自实验的原始数据稍加整理和注释后,各自开发一套系统为用户提供数据查询和分析服务, 这一定程度利于用户处理数据, 但仍不可避免地需要用户在多个网站间切换, 寻找感兴趣的数据及服务, 并不得不学习和适应不同的系统使用方法. 有许多二级数据库针对特定的研究内容整合多个一级数据库, 如专注于蛋白质结构家族分类或人类基因组图谱等, 但这不利于相关内容的查询. 因此可以从生物学意义角度选择更综合的多个一级数据库, 整合其数据及服务资源, 为用户提供同一的查询平台. 一. 开发思想 1. 虚拟本地数据库 不同于传统的做法, 该查询平台并不将一级数据库的数据下载到本地提供查询, 而是进行远端分布式查询. 用户在查询页面提交请求,经本地服务器分析后, 生
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