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    RNA-蛋白质的相互作用1

    nbsp;                                 4μlDTT(40mmol/L)                                   0.5μlNTP混合液(用于H-RNA或X-RNA)                 2μlRNA酶抑制剂                         0.5μl(约15单位)H2O              对H-RNA加8.5μl或对X-RNA加2.5μl为避免DNA的亚精胺沉淀,须在室温或37℃加各种试剂。 注:H-RNA 用于体外加工测试;X-RNA 用于UV交联测试NTP混合液(H-RNA用):5 mmol/L GTP,CTP,ATP   0.25mmol/L UTPNTP混合液(X-RNA用):5 mmol/L GTP,CTP,ATP2.向反应液中加入2μl(对H-RNA)或8μl(对X-RNA)α-[32P]UTP。3.加0.5~1μl(即10~20单位)SP6,T3或T7聚合酶使反应终体积为20~20.5μl。4.37℃温育40~60分钟。5.加入15μl 5mol/L乙酸胺和100μl 100%乙醇沉淀RNA。6.-20℃放置10分钟,4℃离心10分钟。7.弃上清,空气和真空干燥RNA沉淀,用7μl甲酰胺染液重悬RNA。8.在沸水中将RNA重悬液煮3分钟后,于冰上快速冷却,加样于6%的变性丙稀酰胺凝胶。9.用Saran®膜包上凝胶,对X光片曝光约20秒。10.  切下含有RNA的凝胶片放入1.5ml微量离心管中。11.  在该离心管中加入:DEPC处理过的水                              180μlDEPC处理过的乙酸钠(3mol/L, pH5.5)          20μlDEPC处理过的EDTA(0.25mol/L)                 1μlSDS(20%)                                    1μl12.  在65℃温育1~1.5小时或40℃下过夜使RNA从凝胶中扩散出来。13.  将RNA液转移入新的微量离心管中,加入500μl 100%乙醇,-20℃放置10分钟。计数契仑科夫辐射。14.  离心10分钟沉淀RNA,弃去上清,真空下干燥沉淀,在进入下一操作前用合适的缓冲液重悬RNA。
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