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PCR的假阳性问题深受重视,但我个人认为PCR假阴性问题相对于临床检测更为严重。其实PCR假阳性的问题是比较单纯的,一般仅涉及污染和引物的非特异性问题。而污染可以通过严格的实验室管理,合理的环境设置,以及加入UNG酶抗污染基本可以解决,而引物的非特异性问题基本属于厂家试剂质量问题。而PCR的假阴性却不同,它涉及了与PCR实验的几乎所有人员和技术环节,十分复杂。就临床而言,大三阳检出率低、甚至于GC镜下都很多时,PCR仍为阴性的事情也经常发生,可见假阴性问题的严重性。 就PCR假阴性问题总体来说有如下因素:一. 仪器因素 PCR实验对仪器的依赖性是很高的,离心机、扩增仪都是造成PCR假阴性的因素。扩增仪的主要问题是孔间差,引起扩增失败可扩增效率降低。而离心机的影响则更容易被忽视。国内使用离心机很少使用离心加速度(XXXg)作为参数指标,而常使用转数作为参数指标,这里就存在着一个问题,由于离心机的大小不同,有效跳心半径也不相同,因此同样的转速所产生的离心力相差很大(有的在数倍以上),所以在相同的离心时间下,有可能模板并没有离心下来,造成PCR假阴性。这个问题在其他实验也有,但因基他实验都是测定大分子蛋白沉淀,对离心的速度要求较低所以不太明显。建议使用小型台式离心机的实验要注意一下这个问题。二. 试剂质量问题 PCR实验的成功与否试剂的质量至关重要,试剂的质 < 1 > < 2 >
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