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;-基因的突变:在α-基因的突变中,以 缺失型突变最为常见,其缺失的范围可从两个α-基因均缺失至一些小片段的缺失均 可在人群中检出,α-基因的另一突变即为单碱基置换,目前已发现的突变有18种以 上,它包括错义突变,无意突变剪接部位突变及起始信号突变.(二)β-基因的突变: β-基因的突变以点突变为主,即单核苷酸置换是β-基因的主要突变类型,它亦有碱基的括入和缺失,在我国检出的β-基因点突变见下表: 位置 性质 对基因功能影响 类型 启动子区(TATA) -32 C→A -30 T→C mRNA转录效率下降 -29 A→G β链合成减少 β+ -28 A→G RNA剪接基因突变 IVS-1n+1 G→T IVS-1n+5 G→C mRNA合成异常 β+ IVS-13 T→G IVS-2n+654 C→T 误义突变 CD26 G→A 正 无意突变 CDn A→T β链合成短 β CD43 G→T 突变 缺失: CD8—AA CD31—C CD41/42-TCTT 括入 +40±43-AAAC CD14/15+G CD27/28+C CD71/72+T,+A 起始裂解 ATG→AGG 四、PCR技术在α地贫基因诊断中的应用 α地贫是由α珠蛋白基因不同范围的缺 失及点突变所致,但以缺失型突变最为常见,因此,α地贫PCR诊断的主要任务就在于快速检出α珠蛋白基因的缺失片段.(一)α基因全部缺失(--1--)的PCR诊断 α基因全部缺失所引起的临床表现为HbBar+胎儿水肿综合征,用PCR方法检测等,其反应体系组成如下: 引物: PC01;5TACTGTAGATACCCGTGTACAA3 PC02;5ATCARGGAAACATAGTAAT3 PC03;5ACACAACTGTGTTACCTAGC3 PC04;5CAACTTCATCCACGTTCACC3 扩增片段:αPC01-PC02;136;- βPC03-PC04;110;110 扩增条件:93℃(30);45℃(30);65℃ 检测:3%珠脂糖电泳 注):PCO3和PCO4扩增片段位于β基因,作为内对照. 结果判定:在正常人PCO1-PCO2扩增片段为B6bp,PCO3-PCO4为110bp,而HbBart胎儿水肿综合征仅有PC)3-PCO4的110扩增片段而无PCO1和PCO2的136bp扩增产物.(二)部分α基因缺失型的PCR检测 除HbBart胎儿水肿外,在α地贫中,尚有部分α基因缺失的类型,它仍是α地贫2,α地贫HbH病,应用PCO1和PCO2时正常和缺失染色体均有扩增,因此对2,2,HbH及正常个体不能鉴别,因此又有人设计了一组新的引物体系进行α基因缺失的检测,该本系的组成及操作过程如下 引物名称 序列位置 S1 F5GTGTTCTCAGTATTGGAGGGAA3 4 S1 3端 S2 F5GACACGCTTCCAATACGCTTA3 α3HVR 5端 S3 R5CTACTGCAGCCTTGAACTCC3 4α2 5端 α1 F5CGGGCCTGGGCCCTCGGCCC3 R5CCACGGGGGTACGGGTGCAG3 二者的3端 α2 F5CGGCTGCGGGCCTGGGCCGC3 R5ATTCCGGGACAGAGAGAACC3 五、PCR技术在β地贫基因诊断中的应用 β地贫的基因突变主要是单碱置换.目前在世界范围内发现的单碱基置换达160余种,其中在中国发现的有21种,由于β珠蛋白基因的突变主要为单碱基碱置换,因此其诊断途径与β地贫完全不同,其诊断的主要目的即检出点突变.(一)检测已知突变位点 1.PCR-ASD与ROB PCR-ASO是快速简便的检测已知β珠蛋白基因点突变的方法,主是利用PCR技术扩增靶基因的适当片段,然后用人工合成的含突变位点的标记寡核苷酸探针,逐一筛查,泛检测的反应体系包括. 引物:见下表 引物名称 位置 序列 扩增片段大小bp βA -129--104 A5GTACGGCTGTCATCACTTAGACCTCA3 A→B600 βB 编码97-89 B5TGCAGCTTGTCACAGTGCAGCTCACT3 C→D422 βC EVS-2475-476 C5GTGTACACATATTGACCAAA3 A→D1502 βD 编码114→108 D5AGCACACAGACCAGCACGTT3 41 点膜与杂交:PCR-ASO是将PCR扩增产物点于杂交膜上,然后与上述的ASO探针杂交,根据杂交的结果判断分析,以确定突变位点RDB以改传统的杂交途径,它是将一系列的标记ASO探针固定在膜上,然后用之与PCR扩增产物进行杂交,使检测程序大大简化. 张是增等人根据我国常见的β基因突变情况,将18种5突变分为两组,一组为常见的,另一组为非常见,与这些突变相对应的ASO探针反分为两组,将这些探针固定于膜上,再与相反的PCR扩增产物进行杂交,常用的7种ASO探针可检出98%的中国人β基因点突变同RDB方法简便,快速,使用非同项素标记的ASO探针使之节约于推广,而是探针膜条便于保存和运选. 2.等位特异PCR(ASAPCR) ASAPCR是检测已知β基因突变优点进行β地贫基因诊断又一有效手段,有人用该方法检测Cordows41-42,TVSnt654,CD17TATA盒-28和CD71-72,这五种我国南方常见的β基因点突变诊断β地贫,完成的用于产前诊断. 3.PCR-RFLP检测引起内切酶切点改变的突变诊断β地贫. 突变位置 内切酶 切点影响 β MnlⅠ 丢失 CD17 MaeⅠ 生成 -29 NIaⅢ 生成 CD43 HinfⅠ 消失 TVS-1nt1 BsPMⅠ 消失 CD41-42 HinFZ 酶解产物变化 (二)突变性质不明β地贫的诊断 在β地贫中,尚有一部分人群的基因突变性质不明,但临床表现为β地贫则可用PCR-SSCP、PCR-DGGE、PCR-TGGG进行突变片段筛查,然后对异常的片段进行快速测定,以确定突变位置性质及β地贫的关系. < 1 > < 2 >
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