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我们描述一种大聚合酶链反应(PCR)应用的方法,使在已知序列的核心区边侧的未知 DNA成几何级数扩增。用适当的限制性内切裂解含核心区的DNA,以产生适合于PCR扩 增大小的片段,然后片段的末端再连接形成环状分子。PCR的引物同源于环上核心区 的末端序列,但其方向性,使链的延长经过环上的未知区而不是分开引物的核心区。 这种反向PCR方法可用于扩增本来就在核心区旁边的序列,还可应用于制备未知序列 探针或测定边侧区域本身的上、下游序列。引言 通常测定一个与已知序列相邻的DNA序列是必要的,例如位于编码DNA的上游和下游两 侧的区域,转位因子的插入位点以及克隆于Lambda、科期粒或酵母人工染色体载体上 的DN*段末段的未知序列的探针等。这种末端特异探针在Southern Blot或染色体步 查(Chromosome walking)所需的噬菌斑杂交或克隆杂交中都十分有用。 要得到边侧序列的探针一般需要进行一系列费时、费力的工作,首先用内切酶裂解和 用已知边侧序列的探针Southern杂交以确定大小适合于克隆的末端片段;这些片段还 要经过凝胶分离、克隆,得到的物质再与已知边侧区域杂交以确定合适的克隆子。要 测定未吞边侧区序列时,通常需要从克隆中进行各种片段的亚克隆。 为避免这些步骤,我们采用扩展的PCR方法,使相邻边侧区域得以扩增。典型的PCR扩 增使用与互补链杂交的寡 < 1 > < 2 >
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