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因植株之筛选及色素基因表现与产物分析︰经基因转移后再生所得之植株，需以抗生素、聚合酵素连锁反应、南方、北方及西方型转渍等筛检方法，筛选出含有目标基因及表现正常之转基因植株。由于目标基因属外来基因，可能嵌入目标作物的基因组之任一位置，而影响原有基因之正常表现，因此，含有目标基因之转基因植株，需经数代的基因表现分析、基因稳定性测试及遗传分析，确定此一外来基因可于世代间稳定表现，才算是成功的基因转移。 转基因新花色品种之育成与上市︰基因工程品种因含外来基因，并非天然的作物品种，因此，世界各国对转基因植株之育成，及其产品上市过程，均有严格之规范，以维护现有作物品种之安全，除避免转基因在自然界随意扩散，更要保障消费者的安全。花卉主要为观赏用，且一般均以盆栽或设施方式于温、网室内栽培，对环境生态的可能冲击较一般转基因植物小，只要不随意丢弃或自行于户外栽植，应是安全的。因此，未来消费者对转基因花卉品种之接受程度，较其它基因改造有机体产品高且容易，市场阻力小，发展空间极大。 目前利用基因工程技术成功创造新花色的实例有：矮牵牛、花烟草、菊花、非洲菊等，蓝色康乃馨与蓝玫瑰更声称已成功育出，唯仍未见有标示转基因花卉品种上市，可能与基因改造有机体的规范有关。
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