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将质粒DN-段导入无关的多拷贝复制子中并检测待试质粒共存于杂交体的能力，可以鉴定是否是质粒DNA的该区段产生不相容性。例如，严紧型低拷贝数质粒pSC101的不相容基因座位于复制起点中以约20bp为单位的多次正向重复区，即所谓重复子(iteron)。重复子似乎与邻近的顺式作用的par基因座一起，通过封闭由质粒编码的RepA蛋白将质粒DNA分子“铐”起来，从而阻止其对宿主编码的蛋白质与复制起点结合的诱导(综述见Nordstrom 1990)。相反，对于前已述及的colE1，其不相容性是由RNAⅠ的抑制活性决定的(综述见Novick 1987)。在RNAⅠ上为等位基因且用于调控复制的任何两个不同质粒是不相容的，无论它们是否具有其他相同功能( Tamizawa and Itoh 1981)。 如前所述，目前所用的大多数载体均带有来自pMBl质粒的复制子。这些载体与其他携带colE1复制子的所有质粒均是不相容的，但与带有重复子结合复制子的质粒，如pSC101及其衍生物则是完全相容的。表1-2列出了几种常用质粒及其复制的负调控元件。表1-2 质粒及其复制的负调控元件 不相容组 负调控元件 备注 colE1,pMB1 RNAⅠ 调控前体RNAⅡ加工成引物的过程 incFⅡ,pT181 RNA 调控RepA蛋白的合成 P1,F,R6K,psciui,p15A 重复子 封闭RepA蛋白
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