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制备基因组DNA是进行基因结构和功能研究的重要步骤,通常要求得到的片段的长度不小于100-200kb。在DNA提取过程中应尽量避免使DNA断裂和降解的各种因素,以保证DNA的完整性,为后续的实验打下基础。一般真核细胞基因组DNA有107-9bp,可以从新鲜组织、培养细胞或低温保存的组织细胞中提取,常是采用在EDTA以及SDS等试剂存在下用蛋白酶K消化细胞,随后用酚抽提而实现的。这一方法获得的DNA不仅经酶切后可用于Southern分析,还可用于PCR的模板、文库构建等实验。根据材料来源不同,采取不同的材料处理方法,而后的DNA提取方法大体类似,但都应考虑以下两个原则:(1)防止和抑制DNase对DNA的降解;(2)尽量减少对溶液中DNA的机械剪切破坏。一、试剂准备1.TE: 10mM Tris-HCl (pH 7.8); 1mM EDTA (pH 8.0)。2.TBS: 25mM Tris-HCl (pH 7.4); 200mM NaCl; 5mM KCl。3.裂解缓冲液:250mM SDS; 使用前加入蛋白酶K至100mg/ml。4.20% SDS5.2mg/ml蛋白酶K6.Tris饱和酚(pH 8.0)、酚/氯仿(酚∶氯仿=1∶1)、氯仿7.无水乙醇、75%乙醇二、操作步骤(一)材料处理1.新鲜或冰冻组织处理:⑴ 取组织块0.3-0.5cm3, 剪碎,加TE 0.5ml < 1 > < 2 >
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