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PCR/RT-PCR指南---增加PCR灵敏度(6) |
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DNAzol® Reagents Fast, phenol-free DNA isolation 模板浓度 起始模板的量对于获得高产量很重要。对大多数扩增满意,104到106个起始目的分子就足以在溴化乙锭染色胶上观察到。所需的最佳模板量取决于基因组的大小(表9)。举例说,100ng到1μg的人类基因组DNA,相当于3×104到3×105个分子,对于足以检测到单拷贝基因的PCR产物。质粒DNA比较小,因此加入到PCR中的DNA的量是pg级的。 表9. 基因组大小和分子数目的比例 Genonic DNA Size(bp)* Target Molecules/µg of Genomic DNA Amount of DNA(µg) for -10^5 Molecules E. coli 4.7×10^6 1.8×10^8 0.001 Saccharomyces cerevisiae 2.0×10^7 4.5×10^7 0.01 Arabidopsis thaliana 7.0×10^7 1.3×10^7 0.01 Drosophila melanogaster 1.6×10^8 6.6×10^5 0.5 Homo sapiens 2.8×10^9 3.2×10^5 1.0 Xenopus laevis 2.9×10^9 3.1×10^5 1.0 1.0Mus musculus 3.3×10^9 2.7×10^5 1.0 Zea mays 1.5×10^10 6.0×10^4 2.0 pUC 18 plasmid DNA 2.69×10^3 3.4×10^11 1×10^(-6) *Haploid genome size 酶的选择 除了使用高质量模板DNA,聚合酶的选择也会影响产量(见第十三章,PCR聚合酶的比较)。Platinum聚合酶比其他聚合酶产量高,因为它防止了PCR反应配制过程中的非特异性扩增(图24)。对长片段(最大到12kb)的高灵敏度PCR,应选择酶混合物,最好是Platinum形式,如Platinum Taq DNA Polymerase High Fidelity。这种酶结合了Platinum技术和酶混合物(Taq DNA聚合酶同带有校正功能的聚合酶混合物)的优点。 < 1 > < 2 >
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