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    蛋白质纯化经验指南(3)

    右,另一种等电点9左右,为什么都可以用CM阳离子交换纯化?(用的缓冲液都呈中性)等电点5的那个我觉得选择阴离子交换柱好些,为什么不这样?没有什么特别的原则,重要是纯化的效果好就可以,一般都是先选择弱的.纯化是把目标蛋白和杂质分开就可以,所以其实在这样的情况下,酸性蛋白是挂在阴离子柱上,而后面的挂不住,但是只要能把它们和杂质分开就可以.所以酸性蛋白流穿,杂质被吸附也可以,所以不一定非要吸附也可以.  4)我准备用30%-60%硫酸铵沉淀透析、离心后去上phenyl-sephorase柱。但发现活性大部分还在沉淀中。测了一下蛋白浓度是20mg/ml。是不是浓度太高啊? 也不是,其实沉淀你可以做仔细点,例如先用30%沉淀,取上清,再把上清加到40%,然后如此类推,一直到60%,然后测定沉淀和最后上清的活性,这样就知道哪样的浓度沉淀效果比较好,既然你的活性都在沉淀里,那直接溶解在一定浓度的盐中,直接过滤上柱子就可以,浓度高也没有关系. 5)急问:我的样品蛋白液本来放在4C保存,谁知有人把温度调到了18C已有一天,请问这样对蛋白会有多大影响?我纯化的是一种酶。另外,树脂在这样的温度下性质会有所改变吗?某人说4C-30C的情况下,树脂不会有太大改变。是这样么?谢谢!不知道你的蛋白稳定不稳定,你可以测定一下活性看看,如果没有什么变化,那就没有关系,树脂不会因为温度有什么变化的,尤其是你的树脂不是以蛋白为配基的亲和填料.,没错在4C-30C的情况下是没有多少改变,但是那也看多长时间,什么树脂,因为时间长会长菌如果不加抑菌措施的话. 6)我用鼎国的sepharose 4-B 合成亲和柱可以吗?是活化好的吗,还是普通的琼脂糖,他们的填料颗粒有的比较粗,不知道你选择的粒径是多少范围的,最好要细一些,45-165um比较好,用一般应该没有问题. 7)比如说,sephadex G-25的分级范围是1000~5000,我想问一下,分子量小于1000的分子(例如盐)是怎么样通过的?它是从凝胶内部通过吗?不是说只有1000~5000大小的分子从凝胶内部通过吗?凝胶的中间有的是大小不同的孔,盐自然在这些孔中间通过,而所谓的分离范围也只是说在这样的分子范围内有差别,离开这个范围就没有分离效果,所以小的和大的都没有什么分离效果,因此不是只有1000~5000大小的分子从凝胶内部通过.而是在这个范围的分子有分离效果.  8)请教:要从发酵液中纯化出一个分子量约为1100的具有抗菌活性7肽,前期的提取采用的是酸沉醇提的方法,粗提物中蛋白含量39mg/ml。资料上说,纯化这个小肽要用sephadexLH-20,可是我没有。:(尝试用sephadax G15 进行了纯化,出现了五个没有分开的峰,第六个峰分的还算可以。考虑到可能是粗提物中的组分太多,于是对粗提物用sephadex G200进行了纯化,得到一个单一峰,收集后,冷冻干燥,再过sephadex G50,得到两个吸收峰,可是实验发现,这两个吸收峰没有抑菌活性了:(洗脱液用的是pH7.0的PBS,检测波长280nm。请问可能出现的问题有哪些?洗脱液选择的有问题?检测波长有问题?{我的这种多肽,资料上说HPLC的检测波长为210nm,也有205nm的。} 你的问题很不明确,用sephadexLH-20纯化除了有一部分凝胶过滤外,还有一些分配色谱的作用,所以这个介质和sephadax G15 是不太一样的,你纯化出多少峰都应该进行抑菌实验,否则很难知道你要的组分在哪里.既然这个分子量这么小,那你上sephadex G200,估计你的目标多肽在最后面,所以你得到的那个峰不一定有你要的东西,而在后面,我是这样猜测的,关键你要测定活性,所以你再纯化也没有活性,问题在于你没有时时做活性检测,填料选择不很正确,检测波长我不清楚对不对,关键你要选择合适的柱子,同时每一步都做活性检测.  我确实是对每个峰都作了抑菌实验,Sephadex G15的每个峰都有抑菌活性.粗提物上G200只得到了一个吸收峰,要是我要的组分在后面,可它连个小峰都没有呀.。此外,有人建议我,先使用硅胶柱对粗提物进行处理,请问可供选择的柱子有哪些?谢谢。 那你没有说明G200的峰是不是有活性,你也可以考虑硅胶填料,那得选择c8或者c4的反相硅胶的柱子,可以做HPLC,这样也是不错的选择,毕竟通常的凝胶柱子很难有很好的分离效果。 9)如果我用sephadex G-25脱盐,如何选择缓冲液?因为我认为,如果选择含盐的缓冲液,本身带入了盐,能起到脱盐的效果吗?如果选择含盐的缓冲液,缓冲液里含有的盐会最后流出来吗?另外,分子筛有没有载量的问题?缓冲液选择看你需要什么缓冲液就选择什么,没有什么特别的要求.你的缓冲液当然是没有盐的,否则那何必除盐呢.含盐缓冲液当然不能去掉盐了,它只能把你样品中的盐去除,用的原理是蛋白在柱子中走得比盐要快,所以先出来.如果你缓冲液中有盐那虽然盐有后出的原理,但是因为你一直用含盐的缓冲液去冲柱子,所以它的盐是去不掉的,这和样品中的盐是不一样的.分子筛其实也有载量的问题,但是关键还是看上样的体积,例如分离上样体积不能大于10%柱床体积,脱盐不能大于30%,具体的数和样品有很大关系.  10)既然这样,我想完全脱盐时,洗脱液可以选择水吗?因为缓冲液中的缓冲对总会有盐的存在,对不对?是的,只要你的样品在水中溶解得很好,而且很稳定,那选择水就可以.  11)请教色谱兄,我现在用纤维素分离纯化蛋白和peg-蛋白,跑完我用page检测了一下,没有完全分开,有一些是一起流出来的,我想知道为什么分离效果不好?我该如何调整阿?加长柱子可行吗?还是要更换介质阿?我用的梯度洗脱。多谢拉!peg-蛋白要想完全分开是比较困难的,因为PEG修饰的程度不一样,所很难完全分开,不过纤维素分离的效果是要差点,你可以通过延长柱子,降低流速,延长梯度的办法来提高分辨率,不行你可以换琼脂糖系列的,但是我觉得你也可以考虑疏水,这两个方法都可以.此外洗脱你也可以用不同盐浓度阶段洗脱,这样有时候分离效果也不比梯度的差.  12)非常感谢色谱兄,琼脂糖的比纤维素的好很多吗?另外,上次你给我了份材料没有价格,能否给份有价格的材料,这样也好和老板谈谈,因为老板控制的挺严,谢谢!![email protected]有的,到时候发给你吧。琼脂糖肯定比纤维素分离效果要好,载量也大,还有就是柱床体积不会变化,流速高。 13)想请较:质粒纯化中超螺旋和线性的如何实现有效分离(制备规模),且不使用plasmidselect之类亲和介质。亲和是最有效的方法,我们有现成的工艺,包括去内毒素,你可以把你的邮件pM给我,我给你发一份相关的材料,你可以看看。 14) 我所纯化的蛋白质大概是66kDalton,进行的亲和纯化。现在出现几个问题想请教:1。用的Ni-NTA进行亲和纯化,以前一直是在250mM咪唑中洗下目标带,现在50mM就有,是不是我的镍柱不太好使。2。因为亲和纯化后我的蛋白在最上面,所以我现在用sephadex G-100,但是我发现效果很差,不仅回收率低,而且也只有小分子量的杂带能去掉。因为在我的目标带下面不久就有一个小的杂带,而且我想把我的蛋白去结晶,那样要求的纯度就很高。这样的话是不是选用的纯化材料不对,而且对于流速和柱子长度要求就很严格了。有可能你的载量下降了,所以才那样,你需要清洗了。我觉得你最好选择新的填料,其实你要是条件好的话,仅一步就可以纯化到95%,我可以把我们的方法告诉你,你pM你的邮件给我就好了。 共2页: 上一页 1 [2] 下一页
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