结构分类数据库介绍

除了基因组数据库和序列数据库外，生物大分子三维空间结构数据库则是另一类重要的分子生物信息数据库。根据分子生物学中心法则，DNA序列是遗传信息的携带者，而蛋白质分子则是主要的生物大分子功能单元。蛋白质分子的各种功能，是通过不同的三维空间结构实现的。因此，蛋白质空间结构数据库是生物大分子结构数据库的主要组成部分。蛋白质结构数据库是随X-射线晶体衍射分子结构测定技术的现而出现的数据库，其基本内容为实验测定的蛋白质分子空间结构原子坐标。90年代以来，越来越多的蛋白质分子结构被测定，蛋白质结构分类的研究不断深入，出现了蛋白质家族、折叠模式、结构域、回环等数据库。[链接1.2.4]列出目前主要的蛋白质结构数据库和信息资源的网址。蛋白质结构数据库PDB早在序列数据库诞生之前的70年代，蛋白质结构数据库(Protein Data Bank，简称PDB)就已经问世。PDB数据库原来由美国Brookhaven国家实验室负责维护和管理。为适应结构基因组和生物信息学研究的需要，1998年，由美国国家科学基金委员会、能源部和卫生研究院资助，成立了结构生物学合作研究协会(Research Collaboratory for Structural Bioinformatics，简称RCSB)。PDB数据库改由RCSB管理[Berman HM，2000]，目前主要成员为Rutger大学、圣地亚哥超级计算中
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