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    RFLP操作要点

    取5μl反应液,0.8%琼脂糖电泳观察酶切是否彻底,这时不应有大于30kb的明显亮带出现。   [注意] 未酶切的DNA要防止发生降解, 酶切反应一定要彻底。   2. Southern转移   (1) 酶解的DNA经0.8%琼脂糖凝胶电泳(可18V过夜)后EB染色观察。     (2) 将凝胶块浸没于0.25mol/L HCl中脱嘌呤, 10分钟。     (3) 取出胶块, 蒸馏水漂洗, 转至变性液变性45分钟。经蒸馏水漂洗后转至中和液中和30分钟。   (4) 预先将尼龙膜,滤纸浸入水中,再浸入10×SSC中,将一玻璃板架于盆中铺一层滤纸(桥)然后将胶块反转放置,盖上尼龙膜,上覆二层滤纸,再加盖吸水纸,压上半公斤重物, 以10×SSC盐溶液吸印,维持18-24小时。也可用电转移或真空转移。   (5) 取下尼龙膜, 0.4mol/L NaOH 30秒, 迅速转至0.2mol/L Tris·Cl,pH7.5/2×SSC,溶液中, 5分钟。  (6) 将膜夹于2层滤纸内, 80℃真空干燥2小时。   (7) 探针的制备和杂交见第九章分子杂交部分。  [注意] 1、 步骤(2)中脱嘌呤时间不能过长。      2、 除步骤(1)、(4)、(5)外, 其余均在摇床上进行操作。      3、步骤(4)中,当尼龙膜覆于胶上时, 绝对防止胶与膜之间有气泡发生, 加盖滤时也不应有气泡发生。      4、有时用一种限制性内切酶不能发现RFLP的差异,这时应该试用另一种酶。
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