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    Northern印迹杂交

    而许多人喜用甲醛作为变性剂。所有操作均应避免RNase的污染。 RNA甲醛凝胶电泳和吸印方法。 <1>试剂: 10×MSE缓冲液:0.2mol/L吗啉代丙烷磺酸(MOPS),pH7.0,50mmol/L醋酸钠,1mmol/L EDTA pH8.0。 5×载样缓冲液:50%甘油,1mmol/L EDTA,0.4%溴酚蓝。 甲醛:用水配成37%浓度(12.3mol/L),应在通风柜中操作,pH高于4.0。 20×SSC; 去离子甲酰胺; 50mmol/L NaOH(含10mmol/L NaCl); 0.1mol/L Tris,pH7.5。 <2>步骤: [1]40ml水中加7g琼脂糖,煮沸溶解,冷却到60℃,加7ml10×MSE缓冲液,11.5ml 甲醛,加水定容至70ml,混匀后倒入盛胶槽。 [2]等胶凝固后,去掉梳子和胶布,将盛胶槽放入1×MSE缓冲液的电泳槽。 [3]使RNA变性(最多20μg),RNA4.5ml,10×MSE缓冲液20ml,甲醛3.5ml,去离子甲酰胺10ml。 [4]55℃加热15min,冰浴冷却。 [5]加2ml5×载样缓冲液。 [6]上样、同时加RNA标记物。 [7]60伏电泳过夜。 [8]取出凝胶,水中浸泡2次,每次5min。 [9]室温下将胶浸到50mmol/L NaOH和10mmol/L NaCl中45min,水解高分子RNA,以增强转印。 [10]室温下将胶浸到0.1mmol/L Tris HCl(pH7.5)中45min,使胶中和。 [11]20×SSC洗胶1h。 [12]20×SSC中过夜转印到硝酸纤维素膜上。 [13]取出硝酸纤维素膜,80℃真空烘烤2h。
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