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(1) 目的基因组DN*段的制备 基本原则：DN*段之间存在部分重叠序列；DN*段大小均一。 分离和纯化真核生物基因组DNA时，通常采用蛋白酶分解和有机相抽提的方法除掉蛋白质及脂类等其他大分子。基因组DN*段化则主要采用物理剪切法和限制性内切酶法。 (2)外源DN*段的全克隆选择适宜的载体，与外源DN*段相连。常用的载体有质粒、噬菌体、粘粒（cosmid）以及YAC。这些载体可以克隆的DN*段长度上限分别约为10、23、45和1000kb。选择载体的主要参数是基因组大小，即基因组DNA序列的长短。例如，构建大肠杆菌（4.6′ 106kb）等基因组较小生物的基因组文库时，采用质粒作为载体便可得到满意的结果：按每个DN*段平均长5kb计算，一个包括5000个DN*段克隆的基因文库就能够代表一个完整的大肠杆菌基因组序列。构建较大基因组的文库时，噬菌体、粘粒以及YAC常被选作克隆载体。通过转化或转导的方法将带有不同DN*段的重组DNA分子导入受体细胞，获得一套包含特定生物体所有DNA序列的克隆。(3)期望重组子的筛选很多方法能帮助我们从基因文库的众多克隆中筛选和鉴定带有特定基因的克隆，它们大多是以杂交探测技术（hybridization probing）为基础的。杂交探测是一种利用能和目的基因序列互补的DNA或RN*段为探针
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