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    杂交

      互补杂交要根据探针的类型、长度以及研究目的来选择优化杂交条件。如用于基因表达检测,杂交时需要高盐浓度、样品浓度高、低温和长时间(往往要求过夜),但严谨性要求则比较低,这有利于增加检测的特异性和低拷贝基因检测的灵敏度;若用于突变检测,要鉴别出单碱基错配,需要故需要在短时间内(几小时)、低盐、高温条件下高严谨性杂交。多态性分析或者基因测序时,每个核苷酸或突变位都必须检测出来,通常设计出一套四种寡聚核酸,在靶序列上跨越每个位点,只在中央位点碱基有所不同,根据每套探针在某一特点位点的杂交严谨程度,即可测定出该碱基的种类。  杂交反应还必须考虑杂交反应体系中盐浓度、探针GC含量和所带电荷、探针与芯片之间连接臂的长度及种类、检测基因的二级结构的影响。有资料显示探针和芯片之间适当长度的连接臂可使杂交效率提高150倍。连接臂上任何正或负电荷都将减少杂交效率。由于探针和检测基因均带负电荷,因此影响他们之间的杂交结合,为此德国癌症研究院的Jorg Hoheisel等提出用不带电荷的肽核酸(PNA)做探针效果更好。虽然PNA的制备比较复杂,但与DNA探针比较有许多特点,如不需要盐离子,因此可防止检测基因二级结构的形成及自身复性。由于PNA-DNA结合更加稳定和特异,因此更有利于单碱基错配基因的检测。我们在这里简单介绍一些常用杂交试剂和消耗品  对于商品化的芯片和Array类产品,通常都有配套
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