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    芯片的构建和阅读

    摘要  制作芯片和获得芯片的数据有许多不同的方法。这里我们介绍了在学术领域中两种芯片的构建和使用。除了详细说明了技术细节外,我们还对组成和方法的优缺点进行了评论,同时还介绍了杂交的方法。用我们所建立和使用芯片的方法来回答生物领域问题的事实证明了这种技术在大学的环境下是可行的。  一种获得基因功能信息的高通量的方法是cDNA芯片。在一块显微镜载玻片上包含了几百至几千个固定的DNA样本,以类似于Northern blot 和 Southern blot的方法进行杂交。了解了这个方法后,我们决定在我们各自的实验室Pennsylvania大学(Penn)和Albert Einstein学院医学部(AECOM)制作了高速,高精度的芯片。这个设备是由Stanford医学院Pat Brown制造的,第一次论证了这个方法的可行性。我们的目标是(1)最终以合理的价格,用一块或几块芯片来检测哺乳动物细胞中每个基因的表达,(2)发展以芯片为基础的绘图方法,(3)兼顾硬件和超作方法,尽可能地提高灵敏度。  玻片的优势  一个理想化的支持物允许探针有效地固定在其表面,探针与目标分子能牢固地杂交结合。与另一种用于制作芯片的标准支持物尼龙一样,玻璃有许多的优点。它也有其特长。首先,DNA样品以共价键的形式结合在处理过的玻片上。第二,玻璃是一种耐用的材料,能够耐高温和高离子强度溶液的洗涤。第三,玻璃不是多
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