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相对于生物的进化历史来说，有些有机污染物被释放到环境中的时间是非常短暂的，微生物与之相互作用的时间就更短了。但是农药等生物外源性物质的广泛使用和对环境的污染，增加了微生物生存环境中的不利因素，用科学术语来说，就是增加了微生物进化的选择压力。这起到了促进微生物的物种发生改变和进化的作用，因为只有那些发生了对微生物本身存活有利的突变（如抗药性、转化能力、降解活性）的微生物，才能继续存在于自然界中。我们人类最感兴趣和有可能加以利用的微生物的新特性，正是它们对生物外源性物质的转化和降解作用。
许多微生物可以对生物外源性物质进行化学转化，使其转变成为毒性较小或易于被其它微生物所降解的化合物。如对杀虫剂DDT和对炸药TNT的转化。
微生物对生物外源性物质的转化主要有以下几种形式：
（1）脱卤（主要是脱氯），如DDT的脱氯；
（2）还原，将生物外源性物质上的取代基，特别是硝基，进行还原；
（3）水合反应，如对有机氰的水合反应，形成无毒的含氮有机化合物。
微生物除了可以转化生物外源性物质外，有些微生物还可以把它们分解掉，因为是把较大的化合物分子一步一步地变小，所以称为降解作用。有些生物外源性物质可以被彻底降解，即变成水和二氧化碳等无毒无害的很小的分子化合物或元素。但
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