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水便会通过腔或孔大量涌入寄主细胞内，使细胞膨胀，甚至破裂。另一种损伤膜的毒素主要是酶类，例如磷脂酶，可以去除磷脂部分的电荷，使寄主细胞的磷脂双层结构破坏，造成细胞裂解。这类膜损伤毒素有时也叫溶血素。
超抗原(SAg)毒素。1989年以来，发现某些细菌毒素，主要是葡萄球菌肠毒素、链球菌致热性外毒素。它们与常规抗原不同，不需要常规抗原而直接结合到细胞或组织的受体上，引起休克等等。
3）根据细菌毒素蛋白质分类。
结合到寄主细胞表面蛋白质的结合类毒素。大肠杆菌的热稳定毒素(ST)和葡萄球菌中毒性休克毒素(TSST—1)属于此类。
转运—受体分子修饰类。许多细菌毒素属于此类。此组毒素具有ADP一核糖基化酶活性，有两个功能区，一是毒性部分(toxic)，另一为载体(vector)。整个毒素的A区(活力区)是一稳定构型，由B结合区携带。B区可结合到寄主细胞表面，通过胞吞作用后转送A区通过膜，从而达到细胞质靶位。例如破伤风和肉毒毒素便属于这类。
膜损伤毒素。它们入侵靶细胞，使细胞膜受损伤而大大增加通透性，这一点对于细胞是致死性的。革兰氏阳性和阴性菌都可产生这类毒素。研究得比较清楚的是葡萄球菌毒素。不同毒素与不同受体分子结合，如霍乱毒素结合的受体是神经节苷酯，白喉毒素则是结合在一种类似生长因子前体的膜蛋白上，苏云金杆菌的结晶δ一内毒素及气溶素的受体是GPI一锚蛋白，绿脓杆菌细胞毒素的受体为水通道蛋白质，等等。
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