纯用于抑制微生物生长或杀死微生物的化学药品很多，我们可以通称为化学灭菌剂。在微生物学实验研究和保藏物资或食品上化学灭菌方法也有重要用途。下表列出了常用的化学灭菌剂。
常用的化学灭菌剂
类型
名称及使用浓度
作用机制
应用范围
重金属盐类
0.05%-0.1%升汞
与蛋白质的琉基结合使失活
非金属物品，器皿
2%红汞
与蛋白质的巯基结合使失活
皮肤，粘膜，小伤口
0.01%-0.1%硫柳汞
皮肤，手术部位，生物制品防腐
0.1%-1%AgN03
沉
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