外生殖器的正常菌群较多,常有表皮葡萄球菌、甲型链球菌、肠球菌(Enterococcus)、棒状杆菌、类杆菌、奈瑟氏菌、不动杆菌(Acinetobacter)、耻垢分枝杆菌、支原体(Mycoplasma)、假丝酵母等。这些菌群也可以在男女两性的尿道口发现。
阴道内菌群随内分泌变化而波动。阴道分泌物中常含有无害的微球菌。初生女婴阴道的酸碱度在5左右,主要为乳杆菌;出生后1个月至青春期,酸碱度升至7左右,主要菌群转为表皮葡萄球菌、棒状杆菌、大肠埃希菌等。青春期后,阴道酸碱度又下降,乳杆菌等重占优势,直至绝经期为止。
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