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Ds所导致的解离事件，似乎还受到另外一个因子的控制。麦克林托克观察到，1944年夏天所种植的那批玉米，它们的籽苗幼叶上出现一种奇特的变异类型，即在幼叶上有一对同源区域（它们来自于一对姐妹细胞），其中一半表现为色素减少，而另一半则相应地表现为色素的增多。从这一逆向关系中，麦克林托克领悟到，一定是在有丝分裂期间，两个姐妹细胞中的一个得到了另一个细胞所失去的因子，该因子与调节突变频率有关，或者说它控制着Ds的解离事件，致使同源区域的色素呈现出逆向关系，这就是Ac因子（Activation，意为活化）。Ac与Ds构成一个控制体系，其中Ac的活动是自主的，亦即它能够自发转座（移位），并影响其它基因的表达；Ds的活动是非自主的，因其中央部分发生缺失，失去了自发移位功能，只有当基因组上有同一族的自主因子（如Ac）存在时，才能够转座（移位）。
遗传学交换实验表明，Ac相当于一个显性因子，它位于9号染色体长臂上，Ac与Ds隔开一段距离，但却能遥控指挥Ds。但是，当欲精确定位Ac时，才发现Ac本身也可移动，又是一个转座因子！
后来的实验又进一步表明，Ds除了能导致染色体解离之外，它还可能引起邻近基因的突变。当Ds插入显性有色基因C附近时，致使C突变成为无色隐性基因c，或者说抑制了C的显色功能，于是，在籽粒有色的背景上就出现
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