工学院和生命技术公司的研究人员开发了一套可让RNA测序适用于任何细菌的程序。
在使用这种技术研究B型炭疽的过程中,研究人员对收集自不同条件下生长的B型炭疽细胞进行了测序。他们采集了超过2亿7千万个序列“标记”,其中每一个序列相当于一个RNA分子的短片段,然后,他们使用自己开发的定制软件工具将其拼接在一起。
研究人员表示,这些数据一旦合在一起,就很容易看到基因组的转录结构,也就是看到基因组的转录和非转录区域间的清晰边界,这代表了个别转录开始和终止的地方。这些转录边界准确地告知研究人员在哪里可找到管理基因表达的调控序列,而这些序列是其他方法非常难以找到的。
研究人员还发现,RNA测序本质上只是一种高通量的计数技术,它提供了一种方法来决定细胞中的转录有多丰富。该方法在测量基因表达时要比传统的微阵列方法具有高得多的灵敏度。将一个细菌基因组中每个基因的结构和丰度信息相结合,研究人员就可以采取更为合理的方法来完成抗生素发现和微生物工程设计这样的工作。
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时间:2009-4-20 22:48:59
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