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与细胞融合正好相反，在“神舟”四号上首次进行的生物大分子和细胞的空间分纯化实验，是将生物样品通过电泳的手段分离提纯。连续自由流电泳分离具有效率高、设备操作简单、分辨率好、过程和条件可控、对产物机械损伤小等优点，是制备型的主要分离手段。
据科学家介绍，在陆地上进行的电泳实验，分子因重力影响而产生热扩散，使样品的分离效果大幅度降低。而在太空环境中的电泳实验，消除了重力影响，样品的分离率大幅度提高。
在“神舟”四号上安排的电泳分离实验，主要目的是研究在微重力环境下有关电泳迁移率及各种影响因素而导致的动态过程稳定性控制、分辨率控制以及空间制药分离纯化设备的设计技术等问题。设备由我国自行研制，使用的实验生物样品为细胞色素C和小牛血红蛋白，在轨连续分离时间设计为1个小时。通过实验积累经验，为我国的连续自由流电泳技术的研究发展奠定基础。
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