马拉维湖国家公园海拔高度在1，140米以上，年平均温度为22.7摄氏度，年均降水量为766毫米。该公园的马克里尔海角是由许多被丛林覆盖的小山组成的，山体多由黑云母花岗岩构成，十分险峻。马拉维湖是一个独立的生态地理分区，估计它形成于100-200万年前。湖中几乎所有的岩石岛屿都互不相连，而且它们与大陆
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位于宽阔的马拉维湖最南端，湖水清澈深邃，背后群山相伴。 马拉维湖国家公园保护着上百种当地的特种鱼类。 其对于进化研究的重要性可与厄瓜多尔西部的加拉帕哥斯群岛上的雀类研究相提并论。