财政年，用于阿富汗秘密战争的开支已达到每年2.5亿美元。
1985年３月，里根总统签署了国家安全指令166号文件，该指令要求增加向圣战者提供的军事援助，并明确指出这一努力的目标是将苏联人逐出阿富汗。按照这一新政策的要求，中情局向游击队提供了用于Ｃ-４炸药的延时定时器、远程狙击枪、反坦克导弹。此外，中情局甚至大慷其慨，向游击队提供了美国人千辛万苦搞来的阿富汗战场苏军目标的卫星侦察数据、苏军的军事计划和通信情报。
为了将近３０亿美元的-通过庞大的秘密运输网运送给抵抗组织，中情局花了大量心思，购买了几千头田纳西州的骡子，这些骡子千里迢迢远赴南亚，从巴基斯坦通过崎岖的山路向阿富汗运送武器。此外，中情局还玩开了-手腕，向游击队提供了近２０亿的阿富汗-，让他们贿赂政府官员，瓦解政府组织，动摇政府军心；同时用于向运送物资的人员支付报酬。
1986年10月，侵阿战争正酣，占绝对优势的苏联空军对抵抗组织的打击日益严重。一天，驻贾拉拉巴德机场的苏军直升机部队像往日一样旁若无人起飞升空，准备对游击队的根据地进行突然袭击。不料刚刚起飞，对面山坡上就飞来３道火光，３架米-２４直升机当即被撕得粉碎坠落下来，苏联人大惊失色，不知道阿抵抗组织强烈的防空炮火来自何处。击落米-２４直升机的是美国人的杰作。“毒刺”是美国第二代便携式地空导弹，装备红外、紫外“双色”导引头，中情局行动部处理部长爱德华对此评论说：“一个没有受过教育的阿富汗抵抗运动成员也可以轻易地用‘毒刺’导弹击落价值数百万美元的苏军飞机。”但美国为是否向阿富汗援助“毒刺”导弹曾大起争执。美国国防部担心这种先进的防空武器落入敌手，反对向游击队提供“毒刺”地对空导弹。
1986年３月，一番激烈争论后，美国作出向游击队提供“毒刺”导弹的决定。阿富汗游击队秘密派遣一批队员到巴基斯坦培训，很快就掌握了“毒刺”导弹的发射技术。到当年夏天，第一批共150枚“毒刺”地对空导弹交付给了阿富汗游击队。
首战告捷，游击队士气大振，开始四处伏击。由于“毒刺”的追杀，加上游击队运用的战术非常高明，侵阿苏军飞机损失十分惨重。到1987年年底，仅一年的作战时间，侵阿苏军就损失了近400架作战飞机，直接经济损失高达20亿美元，许多苏军飞行员惨死于“毒刺”之下。“毒刺”在阿富汗上空的无情追杀，让苏军飞机损失与日俱增，使苏联不得不考虑尽快从阿富汗撤军。
1987年下旬，里根政府决定向阿富汗游击队提供远程120毫米迫击炮和扫雷装备，随后苏军在阿富汗的８个主要空军基地和近30个小型机场不断遭到游击队的攻击，游击队还深入苏联领土25公里对苏联目标进行了攻击。包括一个工业目标在内的多个重要目标遭到攻击，这使苏联当局深感震惊。
1988年４月初，大量的美式武器开始涌入阿境内--陶式反坦克导弹、120毫米迫击炮、先进反坦克火炮等，巨型美国Ｃ-５Ａ运输机满载这些-飞往巴基斯坦。这直接导致了苏军开始不断撤军。
1989年２月15日，苏联从阿富汗撤出最后一批部队。听到这个消息，中情局内部一片欢腾。局长韦伯斯特在自己的办公室举行了一次庆祝会，参与阿富汗秘密战争的官员应邀参加。韦伯斯特在祝酒时说，苏联在阿富汗的失败标志着中情局10年隐蔽行动的胜利。美国打赢了冷战期间美苏最后一场秘密战争。
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