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1．基因表达分析 基因表达分析恐怕是基因芯片应用最多的一个方面，细菌、霉菌（尤其是全基因序列已知的酵母菌）、植物、哺乳动物等都进行过研究。并且有不少已有制好的基因芯片作为商品供应，人类基因过于庞大，往往只能局限于一个组织器官，如前列腺也有制好的芯片。 表达分析往往采用平行对比的方法进行。这种方法尤其成功地被用于进化研究，药物、毒物或各种因素对机体的影响等方面。 在医学中芯片最早被用于遗传病的研究。这很容易用结合在玻片上的探针阵列与从受检对象所得标本DNA用PCR荧光标记后进行杂交来检测。 肿瘤研究是芯片在疾病研究很多的领域。癌基因中产生的突变的检测确定，抑癌基因的缺乏和变异，癌细胞多耐药基因的研究都已大量进行。有较普遍意义的P53、Ras、BRCAI、Rb，Bcr－Abl等基因，均已制成芯片可供直接使用。 炎症涉及的基因变化，也已用芯片进行过研究。 病原体的检测和诊断用芯片较易完成。芯片不仅可1次检测多种病毒、细菌等微生物，而且可以鉴别菌株和亚型，这些
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