探索被进化遗弃的有害DNA<%=id%>

序计划那样去探索进化中保守的基因序列，他们的研究目标却是在搜索 “原始子”：威胁生命活动的DNA序列或氨基酸链。
... “像是在大海里找不知长相的细针一样，”伯依斯州立大学（美国爱达荷州）的遗传学教授Greg Hampikian（项目负责人）介绍，“但肯定会有一些DNA或蛋白质序列与生命活动不相称，如它们可能会与一些关键的细胞成分结合，从而被信号通路或是代谢通路之类的摒弃了。它们可能对一些物种有害，而对其他物种无害。我们需要做的就是将这些序列挖掘出来。”
... 为了实现这个目标，Hampikian和他的同事Tim Anderson开发了一套软件，用于计算和搜索所有可能的核苷酸序列。定好序列的长度后，就用这个软件扫描一些序列的数据库，如美国国立卫生研究院(National Institutes of Health)的Genbank，希望从中发现一些世上“不存在”的最小序列。他们将只存在于部分物种中的序列称作“无效子”，在任何生物中都不存在的序列称为“原始子”。
... Hampikian研究队伍有意寻找这种最短的但极为罕见的序列，这样可以尽可能地排除一些偶然因素造成的序列缺失，因为长序列容易被打断、拆散。至今为止，他们已经发现了86条长度为11个核苷酸的序列，这些序列在人类中从未有过报道。
... 同时，他们还识别出了6万多条15个核苷酸长度的原始子，746条5个氨基酸长度的“原始肽”（***），它们在任何生物中都没有报道过。“我们建立的这个数据库涵盖了所有可能的致命性序列” Hampikian自信地说。他希望随着数据库信息的不断补充，可以排除一些假阳性序列。本周，他将在夏威夷茂伊岛召开的太平洋生物计算讨论会上展示他的研究成果。
... 这些序列究竟有没有重要的生物学意义还不清楚，但研究者已经想好了接下来要做的事情：把20条原始肽引入细菌、人类细胞中，以观察它们是否具有致死性或者激起免疫系统的反应。顺着科研思路，Hampikian建议接下去的实验还可能会开展一些有关“*基因”（suicide gene）构建的工作，让这些基因编码致死的氨基酸原始子。“我们可能会设计一些遗传修饰的生物体，如果‘*基因’果真能编码出有害的蛋白，那么生物体肯定会表现出异常症状”。
... Hampikian对他工作的应用非常乐观。他已经从美国国防部获得1百万美金的经费支持用以开发出一套DNA“安全标签”（safety tag）——供法院作为裁定罪犯的参考证据。“这些标签可能并不会致死，但是原始子会让不同个体间的差异轻而易举地显现。”
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