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减数分裂Ⅰ的偶线期中，配对的两条同源染色体之间形成的一种复合结构。它对于维持同源染色体配对的稳定性，以及同源染色体的局部交换，是不可缺少的条件。联会复合体是由核蛋白组成的扁带状三分区结构，总宽度约为150～200纳米。在减数分裂Ⅰ的细线期，每个染色体的两条染色单体之间出现一种宽约30纳米的线状结构，该结构沿染色体全长分布，其两端都与核膜相接触，由它发育成联会复合体的侧生组分。在偶线期中同源染色体配对，互相靠近的同源染色体的两个侧生组分伸出L—C纤维，它们以拉链式结构相互锁合，形成宽约100纳米的中间区，中间区的中心为联会复合体的中央组分。中央组分则是L—C纤维在中间区锁合的部位。L—C纤维的锁合在靠近核膜处较早开始，但在同源染色体比较靠近的其他位点上也可能同时锁合。同源染色体间形成联会复合体使它们的配对完成，而且同源染色体的非姊妹染色单体之间进行局部交换和出现交叉。在侧生组分形成之后，如果在偶线期抑制DNA合成或蛋白质合成，则联会复合体不能形成，将导致同源染色体的配对过程受阻，也不会发生同源染色体的交换和交叉。在双线期联会复合体解体。
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