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。研究发现R·RY型三螺旋（C·AT、A·GC和A·AT等）第三条嘌呤链和Watson-Crick双螺旋的嘌呤链以两个反-Hoogsteen氢键相连接，且糖环的二面角限制在anti区。 核磁共振实验在研究R·RY型、内含一个T·CG三碱基体的G·GC三螺旋（Karen, 1994）时，发现所有的糖环构象包括T·CG的转化位点，均采取接近于C2′-endo的堆积形式。在三螺旋中，C2′-endo的糖环构象在每一条链上的分布按下列顺序增加：嘧啶型＜双螺旋的嘌呤链＜第三条嘌呤链。从目前的情况看，有关糖环构象以及R·RY型三螺旋整体结构尚需详细研究。 在R·RY型三螺旋中，第三条核苷酸链的加入引起了扭转角和X位移的变化。结果显示，此三螺旋既不同于通常的A型也不同于B型DNA。双螺旋的碱基对向小沟方向移动了约19nm(原文为-19nm疑为波浪线19nm)，以此来容纳大沟上的第三条链（图3-27）。总之，三螺旋中的双螺旋区似乎并未受到第三条链太大的影响，而且双螺旋区的碱基堆积形式有些像A型DNA。然而与A型DNA不同的是双螺旋区的大部分核苷酸的糖环构象是S型而非N型，R·RY型三螺旋的详细结构仍需进一步研究。
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